新型冠状病毒可以通过血管紧张素转换酶II进入细胞引发肺炎，但对该细胞受体的多组学研究以及基于该细胞受体筛选抗新型冠状病毒中医药的研究还十分匮乏。本研究通过单基因GSEA分析发现，ACE2基因高表达与positive regulation of viral process，regulation of viral life cycle，viral gene expression和viral genome replication密切相关。并且，吸烟患者中ACE2的表达量明显增高，特别是在小气道上皮细胞中（p=4.4e-06）。同时发现，ACE2与SCN10A、ATP9A、ENOX1、C12orf43、B3GALNT2、DDX52、TMEM80、YPEL1、CYP4A11、ZNF853和ADM等基因共表达。最后，基于网络药理学分析，我们发现柴胡、川牛膝、葛花、萱草根和葛根可能直接作用于ACE2，影响其蛋白量表达。我们的研究进一步证实了新型冠状病毒利用ACE2引发临床表现，并找到了可能参与防治作用的候选中医药，从而为新型冠状病毒的防控提供理论及技术支撑。